我國生態(tài)環(huán)境監(jiān)測40多年的發(fā)展歷史大體可總結(jié)為記錄環(huán)境歷史、支撐考核排名、智慧監(jiān)測等三個階段。目前生態(tài)環(huán)境監(jiān)測正處于由第二階段向第三階段邁進的關(guān)鍵期和轉(zhuǎn)型期。達到智慧監(jiān)測的標志即是實現(xiàn)感知高效化、數(shù)據(jù)集成化、分析關(guān)聯(lián)化、測管一體化，應(yīng)用智能化、服務(wù)社會化。

第一階段是記錄環(huán)境歷史的階段。這一階段主要是向西方學(xué)習(xí)階段，完整引進了發(fā)達國家環(huán)境監(jiān)測技術(shù)體系，監(jiān)測目的是客觀評價環(huán)境質(zhì)量。

第二階段是以支撐考核排名為業(yè)務(wù)重心的階段。這一時期，環(huán)境監(jiān)測受重視程度達到空前水平。生態(tài)環(huán)境監(jiān)測對生態(tài)環(huán)境管理的支撐作用日趨凸顯，監(jiān)測隊伍被稱為鐵軍先鋒隊。但是在這一時期，由于監(jiān)測系統(tǒng)人員隊伍與工作任務(wù)沒有同步增長，長期超負荷應(yīng)付各項事務(wù)性工作，監(jiān)測技術(shù)研究特別是理論研究出現(xiàn)了滯后。

第三階段是智慧監(jiān)測的階段。目前生態(tài)環(huán)境監(jiān)測工作正處于由第二階段向第三階段邁進的轉(zhuǎn)型期，不僅要“說清楚環(huán)境質(zhì)量好不好”“哪個地方干得好”，而且還要“說清楚生態(tài)環(huán)境怎樣才能變好”。因為當前污染防治攻堅戰(zhàn)已經(jīng)全面升級，中央提出了“科學(xué)治污、精準治污、依法治污”的要求，污染防治要做到時間、對象、區(qū)位、問題、措施精準，就必須先做到“監(jiān)測先行、監(jiān)測準確、監(jiān)測靈敏”。當前，生態(tài)環(huán)境監(jiān)測工作要從簡單出具數(shù)據(jù)向提出切實管用的綜合管理決策建設(shè)轉(zhuǎn)變。